1990년대 후반, 오사마 빈 라덴과 알카에다가 미국을 향한 위협을 키워 간다. 뉴욕 FBI 대테러 부서 I-49를 이끄는 존 오닐과 그의 팀에 합류한 레바논계 무슬림 요원 알리 수판은 알카에다의 움직임을 집요하게 추적한다. 그러나 같은 적을 쫓는 CIA의 대테러 조직 알렉 스테이션은 자신들이 쥔 정보를 FBI와 나누려 하지 않는다. 케냐와 탄자니아의 미국 대사관 폭탄 테러, 예멘에서 벌어진 미 해군 함정 콜호 테러가 이어지는 동안, 두 기관 사이의 경쟁과 불신은 점점 깊어진다. 경고의 신호가 쌓여 가는 가운데, 이들의 균열은 미국 역사상 가장 참혹한 날을 향해 다가간다.